凌恩生物？2024年6月，凌恩生物助力客戶發(fā)表文章75篇，累計(jì)影響因子531.8分。文章涉及多個(gè)領(lǐng)域，包括Nature Microbiology、Nature Communications、Microbiome、Chemical Engineering Journal、Journal of Hazardous Materials、Water Research等頂尖期刊。那么，凌恩生物？一起來了解一下吧。
凌恩生物隆重推出HiFi-meta技術(shù)服務(wù)，該技術(shù)基于三代宏基因組測序組裝方案，全新升級(jí)為完成圖水平的MAGs。此服務(wù)旨在助力更全面的功能基因挖掘，深入探究可移動(dòng)基因單元與宿主的關(guān)系，歡迎微生態(tài)領(lǐng)域研究用戶垂詢。
研究背景：養(yǎng)雞業(yè)作為我國畜牧業(yè)的重要組成部分，雞腸道微生物群對(duì)宿主健康和生長有著顯著影響。過往研究已構(gòu)建了大量雞腸道宏基因組組裝基因組（MAGs），然而，受限于短讀長測序和組裝技術(shù)，大多數(shù)MAGs質(zhì)量不佳，包含污染reads。
研究方法：選取30只42天齡的嶺南黃肉雞，分別從十二指腸、空腸、回腸、盲腸和結(jié)腸5個(gè)腸室采集150份食糜樣本，進(jìn)行HiFi宏基因組測序。
研究結(jié)果：HiFi reads能夠組裝出更長的contigs。十二指腸、空腸、回腸、盲腸和結(jié)腸的HiFi reads數(shù)據(jù)如下表所示(表1)。HiFi reads的N50長度為17 kb左右，而5個(gè)腸段初步組裝的contig N50大小均在28kb以上，明顯優(yōu)于短讀長宏基因組。此外，覆蓋深度與單堿基質(zhì)量值呈正相關(guān)，表明較高的覆蓋深度提高了序列的精度。研究者成功識(shí)別出61、67、71、81和78個(gè)環(huán)狀質(zhì)粒基因組，以及33、14、14、52和50個(gè)環(huán)狀病毒基因組。
企知道數(shù)據(jù)顯示，上海凌恩生物科技有限公司成立于2014-12-24，注冊(cè)資本2500.0萬人民幣，參保人數(shù)50人，是一家以從事專用設(shè)備制造業(yè)為主的國家級(jí)高新技術(shù)企業(yè)。公司曾先后獲授“國家高新技術(shù)企業(yè)”、“創(chuàng)新型中小企業(yè)”、“國家科技型中小企業(yè)”等資質(zhì)和榮譽(yù)。
在知識(shí)產(chǎn)權(quán)方面，上海凌恩生物科技有限公司擁有注冊(cè)商標(biāo)數(shù)量達(dá)到6個(gè)，軟件著作權(quán)數(shù)量達(dá)到50個(gè)，專利信息達(dá)到8項(xiàng)。此外，上海凌恩生物科技有限公司還對(duì)外投資了6家企業(yè)，直接控制企業(yè)1家。
2024年2月，凌恩生物助力客戶發(fā)表47篇科研文章，累計(jì)IF達(dá)317.3分，涉及《Advanced Materials》、《Microbiome》等頂級(jí)期刊，涵蓋微生物、基因組、轉(zhuǎn)錄組等多個(gè)研究領(lǐng)域。以下精選高分文章進(jìn)行回顧。
論文《Achieving Clearance of Drug-Resistant Bacterial Infection and Rapid Cutaneous Wound Regeneration Using an ROS-Balancing-Engineered Heterojunction》，發(fā)表于《Advanced Materials》，IF：29.4，由四川大學(xué)作者完成。文章借助智能納米催化膜實(shí)現(xiàn)對(duì)耐藥細(xì)菌感染的清除和皮膚傷口的快速再生。該膜通過調(diào)節(jié)活性氧水平，有效治療皮膚感染傷口。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)顯示，該膜能將慢性傷口環(huán)境轉(zhuǎn)化為再生環(huán)境，消滅細(xì)菌、抑制炎癥并促進(jìn)血管生成。
論文《From phyllosphere to insect cuticles: silkworms gather antifungal bacteria from mulberry leaves to battle fungal parasite attacks》，發(fā)表于《Microbiome》，IF：15.5，由中國科學(xué)院作者完成。
2024年6月，凌恩生物助力客戶發(fā)表文章75篇，累計(jì)影響因子531.8分。文章涉及多個(gè)領(lǐng)域，包括Nature Microbiology、Nature Communications、Microbiome、Chemical Engineering Journal、Journal of Hazardous Materials、Water Research等頂尖期刊。以下為部分文章內(nèi)容概要：
第1篇：微生物單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)揭示了瘤胃微生物組的功能異質(zhì)性。文章通過分析2,534種微生物物種的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，揭示了瘤胃微生物組的功能多樣性。研究運(yùn)用宏基因組binning與微生物單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)，構(gòu)建了功能參考基因組，為瘤胃微生物組研究提供了寶貴資源。
第2篇：通過微生物組建模工程改造天然微生物組以增強(qiáng)生物修復(fù)能力。文章基于工程天然微生物組構(gòu)建的合成微生物組，通過模擬不同微生物組的性能，實(shí)現(xiàn)對(duì)被污染土壤的有效治理。研究開發(fā)的代謝建模管道SuperCC為理解微生物組功能提供了實(shí)用工具。
第3篇：研究浮游植物源多糖和微生物肽聚糖作為深海微生物的關(guān)鍵營養(yǎng)物質(zhì)。通過宏基因組與宏轉(zhuǎn)錄組分析，揭示了深海環(huán)境中復(fù)雜的營養(yǎng)來源，強(qiáng)調(diào)了微生物組在生物地球化學(xué)循環(huán)中的重要角色。
凌恩生物全面進(jìn)軍宏基因組數(shù)據(jù)分析服務(wù)領(lǐng)域，繼抗性基因分析和元素循環(huán)分析后，于2022年推出生物降解塑料基因分析，助力環(huán)保事業(yè)。
塑料的大量使用與不當(dāng)處理，導(dǎo)致環(huán)境嚴(yán)重污染，對(duì)海洋生物、食物鏈底層物種乃至生態(tài)系統(tǒng)造成深遠(yuǎn)影響。微生物降解塑料成為環(huán)保領(lǐng)域的關(guān)注焦點(diǎn)，近年來，相關(guān)研究大量涌現(xiàn)。
為克服塑料聚合物分子結(jié)構(gòu)復(fù)雜，微生物難以直接降解的難題，研究人員采用微生物分泌生物降解酶來分解塑料。信號(hào)肽搜索工具如Signalp 5.0軟件，能有效識(shí)別可能的降解酶前導(dǎo)序列，為蛋白質(zhì)降解潛力評(píng)估提供關(guān)鍵信息。
數(shù)據(jù)庫中，蛋白質(zhì)根據(jù)所降解的塑料類型進(jìn)行分類，并在計(jì)算機(jī)上進(jìn)行預(yù)測。用戶能通過各種分析工具，如基因、基因組、宏基因組、轉(zhuǎn)錄組等，深入研究潛在塑料降解微生物和蛋白質(zhì)，以及它們?cè)诓煌h(huán)境中的存在情況。
本次升級(jí)為用戶提供了一個(gè)全面分析各種塑料降解微生物與蛋白質(zhì)的平臺(tái)。借助服務(wù)器提供的工具，用戶能在數(shù)據(jù)集中深入探索塑料生物降解的多個(gè)方面，包括微生物和蛋白質(zhì)識(shí)別、不同數(shù)據(jù)集中降解潛力的比較等，并能以圖形和表格形式進(jìn)行直觀展示。
凌恩生物宏基因組分析團(tuán)隊(duì)秉持精準(zhǔn)個(gè)性化服務(wù)理念，為客戶提供高效、專業(yè)的數(shù)據(jù)挖掘與分析服務(wù)，突破宏基因組發(fā)文瓶頸，挖掘數(shù)據(jù)價(jià)值。
以上就是凌恩生物的全部內(nèi)容，微生物單細(xì)胞測序產(chǎn)品，凌恩生物推出的王炸新技術(shù)，旨在解決原核生物研究中的單菌轉(zhuǎn)錄表達(dá)難題，為農(nóng)業(yè)、環(huán)境、人體及醫(yī)學(xué)領(lǐng)域提供獨(dú)到的單菌水平視角。針對(duì)原核生物研究的局限性，凌恩生物特別設(shè)計(jì)了單細(xì)菌轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)品，分為單菌種產(chǎn)品與腸道菌群產(chǎn)品。
